Có 401 đại biểu chính thức đại diện cho 156.000 đảng viên trong toàn Đảng bộ về dự đại hội. Đại hội vinh dự được đón Tổng Bí thư Lê Khả Phiêu về dự và phát biểu với Đại hội.
Đại hội đã bầu Ban Chấp hành Đảng bộ khoá XIII gồm 51 đồng chí, bầu đoàn đại biểu của Đảng bộ gồm 31 đồng chí đi dự Đại hội lần thứ IX của Đảng. Tại Hội nghị lần thứ nhất Ban Chấp hành Đảng bộ đã bầu Ban Thường vụ gồm 15 đồng chí. Đồng chí Nguyễn Phú Trọng, Uỷ viên Bộ Chính trị được bầu làm Bí thư Thành uỷ; các đồng chí Trần Văn Tuấn, Hoàng Văn Nghiên, Phùng Hữu Phú làm Phó Bí thư Thành uỷ.

Ban Chấp hành Đảng bộ khóa XIII (2001-2005)

Ngày 24/2/2001, theo Quyết định sóo 1098/QĐNS-TW, đồng chí Trần Văn Tuấn, uỷ viên Trung ương Đảng, Phó Bí thư Thường trực Thành uỷ, Chủ tịch HĐND Thành phố Hà Nội thôi giữ chức Phó Bí thư Thường trực Thành uỷ HN để nhận công tác khác.
Ngày 21/2/2003, Ban Bí thư Trung ương Đảng có quyết định chỉ định bổ sung 7 đồng chí vào Ban Chấp hành Đảng bộ Thành phố Hà Nội khoá XIII.