Thực hiện Nghị quyết Hội nghị Trung ương Đảng lần thứ II (tháng 10/1951), Thành uỷ Hà Nội chuyển hướng đấu tranh: Đẩy mạnh đấu tranh chính trị, kinh tế, kết hợp với vũ trang, giữ gìn và bồi dưỡng lực lượng kháng chiến, chấn chỉnh, củng cố lại hệ thống tổ chức của Đảng bộ và các ngành, đoàn thể.

Năm 1951, nội thành còn 18 chi bộ với 208 đảng viên, ngoại thành còn trên dưới 20 ủy viên giữ được liên lạc.

Nhờ sự chuyển hướng tổ chức và đấu tranh trong lãnh đạo và chỉ đạo của Thành uỷ, nhờ tinh thần hy sinh dũng cảm, bền bỉ bám dân, bám đất của cán bộ đảng viên, giữ gìn cơ sở Đảng, phong trào kháng chiến ở Hà Nội từng bước phục hồi và phát triển. Quân dân Thủ đô phối hợp với chiến trường Điện Biên Phủ trong Đông Xuân 1953-1954, tiêu biểu là phong trào đấu tranh đòi giảm thuế môn bài, bỏ thuế thương vụ của chị em tiểu thương (11-13/12/1953), trận đánh Sân bay Gia Lâm (3/1954), phong trào đấu tranh đòi hoà bình.

Cuối năm 1954, Thành ủy Hà Nội chuyển thành Đảng uỷ tiếp quản dưới sự lãnh đạo trực tiếp của Trung ương.